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空間轉(zhuǎn)錄組助力揭示脂肪肝相關(guān)肝癌中的免疫抑制和微環(huán)境重塑

瀏覽次數(shù):249 發(fā)布日期:2025-11-4  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
圖片
 

題目:Targeting Treg–fibroblast interaction to enhance immunotherapy in steatotic liver disease-related hepatocellular carcinoma
期刊:Gut
IF:25.8
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335084

研究背景

脂肪相關(guān)肝細(xì)胞癌(SLD-HCC)作為全球性的健康難題,其腫瘤微環(huán)境(TME)展現(xiàn)出獨(dú)特的代謝與免疫適應(yīng)特性。SLD-HCC不僅引發(fā)免疫抑制,還會(huì)影響免疫療法的治療效果。盡管近年來(lái)免疫療法在肝癌治療中取得了顯著進(jìn)展,但SLD-HCC的應(yīng)答率依然偏低。已有研究指出,SLD-HCC中調(diào)控性T細(xì)胞(Tregs)和癌相關(guān)纖維母細(xì)胞(CAFs)之間的交互起著重要作用,但相關(guān)機(jī)制尚未得到充分的解釋。本研究通過(guò)整合單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組(10x Genomics)及兩種空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)(Visium和CosMx SMI),系統(tǒng)揭示了SLD-HCC TME的演化軌跡,深入探討了免疫監(jiān)視逐漸失效及腫瘤微環(huán)境重塑的過(guò)程,為突破免疫療法抑制提供了新的思路。

實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)與技術(shù)手段

本研究納入了22例SLD-HCC和31例非SLD-HCC患者的樣本,采用多組學(xué)方法深入探討腫瘤微環(huán)境(TME)的特征。研究重點(diǎn)依托以下技術(shù)手段:
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組(10x Genomics):分析患者的腫瘤和非腫瘤組織樣本,揭示不同細(xì)胞類(lèi)型之間的互作關(guān)系,幫助理解腫瘤微環(huán)境中的免疫和代謝特征。
空間轉(zhuǎn)錄組(Visium):對(duì)腫瘤組織進(jìn)行空間轉(zhuǎn)錄組分析,描繪腫瘤邊緣等關(guān)鍵位置的細(xì)胞分布及其分子特征,為揭示腫瘤微環(huán)境的空間差異提供關(guān)鍵線索。
空間轉(zhuǎn)錄組(CosMx SMI):通過(guò)高分辨率的單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組,探索腫瘤微環(huán)境中細(xì)胞的鄰域關(guān)系,進(jìn)一步細(xì)化免疫抑制機(jī)制的局部特征。

多種技術(shù)手段協(xié)同作用,揭示了SLD-HCC的細(xì)胞異質(zhì)性和空間組織特征,并通過(guò)CyTOF、多重免疫熒光和小鼠模型進(jìn)行驗(yàn)證,增強(qiáng)了研究的全面性和可靠性。

主要發(fā)現(xiàn)

1.單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組揭示免疫和脂質(zhì)代謝通路的顯著變化 

通過(guò)scRNA-seq分析,發(fā)現(xiàn)SLD-HCC中調(diào)控性T細(xì)胞(Tregs)、癌相關(guān)纖維母細(xì)胞(CAFs)和內(nèi)皮細(xì)胞(ECs)等細(xì)胞類(lèi)型顯著上調(diào)了脂質(zhì)代謝相關(guān)基因(如APOA2和FABP1),同時(shí)Tregs下調(diào)了抗原呈遞基因(HLA-DRB5)和激活標(biāo)志物(IL2RA),而CD8+ T細(xì)胞則表現(xiàn)出毒性基因(CST7)的下調(diào)。這些變化表明,高脂腫瘤微環(huán)境驅(qū)動(dòng)了細(xì)胞的代謝適應(yīng),從而引發(fā)整體免疫抑制狀態(tài)。
 

圖片單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組揭示SLD-HCC TME的脂質(zhì)代謝與免疫變化

2.Visium空間轉(zhuǎn)錄組描繪Treg-CAF簇的空間組織特征

Visium數(shù)據(jù)顯示,在SLD-HCC的腫瘤邊緣,免疫細(xì)胞與纖維母細(xì)胞高度共定位,形成了一個(gè)免疫抑制的微環(huán)境區(qū)域。進(jìn)一步的解卷積分析發(fā)現(xiàn)Treg-CAF簇顯著富集.。同時(shí), TNFSF14–TNFRSF14(腫瘤壞死因子超家族成員與其受體)的交互強(qiáng)度增強(qiáng),進(jìn)一步推動(dòng)了腫瘤細(xì)胞的免疫逃逸。
 

圖片Visium空間轉(zhuǎn)錄組解析SLD-HCC邊緣Treg-CAF簇

3.CosMx SMI空間轉(zhuǎn)錄組揭示Treg-CAF交互驅(qū)動(dòng)免疫療法抵抗

通過(guò)CosMx SMI分析發(fā)現(xiàn),SLD-HCC中Tregs與CAFs呈現(xiàn)出顯著的鄰域富集(涉及25種細(xì)胞類(lèi)型),并伴隨HLA-E(人類(lèi)白細(xì)胞抗原E,抑制免疫細(xì)胞活性)等抑制分子的上調(diào)。結(jié)合細(xì)胞通訊分析,發(fā)現(xiàn)TNFSF14-TNFRSF14軸在早期前體階段已啟動(dòng)激活,與CD8+ T細(xì)胞的耗竭以及Tregs的積累密切相關(guān),從而加劇了腫瘤對(duì)免疫療法的抵抗。
 

圖片CosMx SMI描繪SLD-HCC Treg-CAF免疫抑制網(wǎng)絡(luò)

4.構(gòu)建免疫演化模型并驗(yàn)證治療潛力

單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組共同勾勒出SLD-HCC從免疫監(jiān)視向免疫抑制轉(zhuǎn)變的連續(xù)路徑。驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)表明,在高脂飲食誘導(dǎo)的HCC小鼠模型中,阻斷TNFRSF14不僅減少了Tregs,還提升了活性CD8+和記憶CD4+ T細(xì)胞的水平,并與anti-PD-1(抗PD-1免疫檢查點(diǎn)抑制劑)療法產(chǎn)生協(xié)同效應(yīng),最終縮小腫瘤體積。研究證實(shí)了該信號(hào)軸作為免疫療法抵抗的關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)因素。
 
圖片
小鼠模型驗(yàn)證TNFRSF14阻斷與anti-PD-1協(xié)同療效

文章總結(jié)

本研究利用scRNA-seq和Visium/CosMx空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái),全面繪制了SLD-HCC腫瘤微環(huán)境(TME)的分子圖譜。研究發(fā)現(xiàn),高脂環(huán)境促進(jìn)了Tregs和CAFs的脂質(zhì)代謝適應(yīng),而TNFSF14-TNFRSF14信號(hào)軸通過(guò)空間組織形成免疫抑制微環(huán)境區(qū)域,從而加劇了免疫療法抵抗;谶@些發(fā)現(xiàn),研究提出了“免疫監(jiān)視→免疫抑制→免疫逃逸”的演化模型,為SLD-HCC的早期干預(yù)和免疫療法開(kāi)發(fā)提供了重要的分子靶點(diǎn)和理論支持。
發(fā)布者:上海生物芯片有限公司
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