年度旗艦級(jí)單細(xì)胞空間組學(xué)平臺(tái)CosMx SMI- Whole Transcriptome Panel(WTX) 不止于單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的突破,更以全轉(zhuǎn)錄組覆蓋(18000+基因)的無(wú)偏檢測(cè)能力,重新定義生命動(dòng)態(tài)圖譜研究的維度。但這還不夠,我們還想要空間蛋白維度的檢測(cè),全景觀觀測(cè)生命過(guò)程、組織微環(huán)境。
當(dāng)傳統(tǒng)技術(shù)困于局部信號(hào)捕捉,WTX已實(shí)現(xiàn)從單細(xì)胞分辨率到全轉(zhuǎn)錄組的無(wú)縫覆蓋,讓組織微環(huán)境中每個(gè)細(xì)胞的表達(dá)密碼都清晰可辨。但我們深知:生命是復(fù)雜的,所以我們渴望更全景的視角:將空間蛋白維度深度融合,實(shí)現(xiàn)對(duì)生命進(jìn)程與組織微環(huán)境的多模態(tài)、全尺度觀測(cè)。
為實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo),我們以“技術(shù)宅”式的嚴(yán)謹(jǐn),將多元技術(shù)模塊視作待選的“食材”:不滿足于簡(jiǎn)單堆砌,而是歷經(jīng)深度適配,沉淀出開(kāi)箱即用的“全棧式解決方案”——讓前沿的空間轉(zhuǎn)錄組與空間蛋白檢測(cè)技術(shù),真正成為您探索生命圖譜的趁手利器。

1. WTX +蛋白panel同片檢測(cè)
CosMx SMI平臺(tái)獨(dú)有的優(yōu)勢(shì)在于,能夠在同一張組織切片上同時(shí)完成全轉(zhuǎn)錄組與多重蛋白的共檢測(cè),實(shí)現(xiàn)真正的單細(xì)胞分辨率空間多組學(xué)同步識(shí)別。當(dāng)前的SMI Protein Panel覆蓋64種關(guān)鍵蛋白,包含免疫檢查點(diǎn)分子(如PD-1、PD-L1、CTLA4)、T細(xì)胞活化標(biāo)志物(CD69、CD25等)以及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)分子(pSTAT1、pAKT)等,為免疫治療機(jī)制研究與免疫微環(huán)境表型刻畫提供強(qiáng)有力支持。
● 主要優(yōu)勢(shì):
單片共檢測(cè):只需一張切片檢測(cè),RNA與蛋白信號(hào)來(lái)源一致,避免跨切片配準(zhǔn)誤差。
功能分子覆蓋精準(zhǔn):以免疫相關(guān)分子為核心,特別適用于T細(xì)胞活化狀態(tài)、免疫逃逸機(jī)制、腫瘤-免疫界面研究。
數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)自然:同一空間區(qū)域,同一細(xì)胞,可直接關(guān)聯(lián)轉(zhuǎn)錄表達(dá)與蛋白豐度變化,開(kāi)展信號(hào)通路活性評(píng)估與細(xì)胞狀態(tài)分類。
2. WTX +PCF
PCF(PhenoCycler-Fusion)利用多輪次成像,突破傳統(tǒng)熒光成像通道限制,支持100種以上蛋白標(biāo)志物同時(shí)檢測(cè),并可以實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞分辨率的空間蛋白組譜繪制。IO60 panel是即用型一款腫瘤及免疫多重抗體組合,涵蓋60個(gè)經(jīng)驗(yàn)證的人源FFPE樣本標(biāo)志物,可在一次實(shí)驗(yàn)中全面解析腫瘤細(xì)胞、基質(zhì)細(xì)胞及免疫微環(huán)境結(jié)構(gòu),為多癌種的腫瘤微環(huán)境構(gòu)成與空間異質(zhì)性解析提供高效標(biāo)準(zhǔn)化方案。通過(guò)將SMI WTX的轉(zhuǎn)錄信息與IO60的蛋白圖譜相結(jié)合,研究者能夠從兩個(gè)維度重構(gòu)腫瘤及其微環(huán)境的全景觀空間圖譜。
● 主要優(yōu)勢(shì):
空間分辨率匹配:IO60可實(shí)現(xiàn)與SMI相同的亞細(xì)胞級(jí)空間分辨率,確保RNA-Protein層面數(shù)據(jù)精準(zhǔn)對(duì)齊。
IO60 panel將腫瘤標(biāo)記物覆蓋全面,細(xì)胞類型解析深入:涵蓋腫瘤細(xì)胞(PanCK、SOX2、TP63、角蛋白家族)、基質(zhì)細(xì)胞(Podoplanin、Caveolin、Collagen IV、E-cadherin)、髓系細(xì)胞(CD206、CD209、MPO)及NK細(xì)胞(CD57、CD107)等多種特異性標(biāo)記,能夠系統(tǒng)刻畫腫瘤、免疫與基質(zhì)間的復(fù)雜關(guān)系。
高度靈活定制:在IO60 panel基礎(chǔ)上可根據(jù)研究目的靈活增加定制蛋白靶標(biāo),兼顧標(biāo)準(zhǔn)化與創(chuàng)新性。
3. WTX +DPA(GeoMx DSP)
GeoMx DSP的DPA(Discovery Proteome Atlas)panel可在單次實(shí)驗(yàn)中同時(shí)檢測(cè)超過(guò)1200種蛋白。這是目前基于抗體的通量最高的商業(yè)化空間蛋白檢測(cè)平臺(tái)。DPA是專為支持生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)而設(shè)計(jì)的檢測(cè)方案,涵蓋多種組織類型、機(jī)制通路及研究領(lǐng)域,包括癌癥、免疫學(xué)和神經(jīng)生物學(xué):
兼容40+種人類組織
涵蓋120+種生物學(xué)過(guò)程
包含29類功能注釋(細(xì)胞凋亡、分化、DNA損傷修復(fù)、MAPK Signaling、mTOR Signaling、PI3K-Akt Signaling等)
當(dāng)DPA與WTX技術(shù)結(jié)合時(shí),可在轉(zhuǎn)錄組與蛋白組兩個(gè)層面實(shí)現(xiàn)“全局+局域”相結(jié)合的空間整合分析。
● 主要優(yōu)勢(shì):
極高通量:實(shí)現(xiàn)從免疫、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、代謝到細(xì)胞骨架等多維蛋白網(wǎng)絡(luò)的全面覆蓋。
靈活的ROI選擇:GeoMX DSP具備精細(xì)的區(qū)域劃分與定向檢測(cè)能力,可針對(duì)特定細(xì)胞類型或病理區(qū)域進(jìn)行深度蛋白分析
互補(bǔ)信息融合:SMI WTX提供精確的空間細(xì)胞分型,DPA補(bǔ)充大規(guī)模蛋白表達(dá)特征,實(shí)現(xiàn)“定域-定性-定量”三重融合。
4. WTX+深度蛋白組(LCM)
通過(guò)LCM(Laser Capture Microdissection)激光顯微切割技術(shù),可在組織水平上精準(zhǔn)切割感興趣的區(qū)域,并結(jié)合質(zhì)譜實(shí)現(xiàn)全蛋白組無(wú)偏檢測(cè)。當(dāng)與WTX組合時(shí),可先通過(guò)轉(zhuǎn)錄組信息識(shí)別關(guān)鍵功能區(qū)域,再由LCM-MS完成深度蛋白挖掘,不受任何抗體限制。
● 主要優(yōu)勢(shì):
精準(zhǔn)切割、區(qū)域特異:依據(jù)組織形態(tài)或SMI識(shí)別的功能區(qū)域進(jìn)行精確定義與切割,確保空間信息精準(zhǔn)可控。
無(wú)偏全蛋白組覆蓋:無(wú)需預(yù)設(shè)抗體panel,可檢測(cè)所有表達(dá)蛋白,發(fā)現(xiàn)未知分子機(jī)制。
機(jī)制驗(yàn)證利器:SMI轉(zhuǎn)錄組信息引導(dǎo)感興趣區(qū)域定位,LCM-MS實(shí)現(xiàn)蛋白深度挖掘,形成空間機(jī)制研究的閉環(huán)路。
從轉(zhuǎn)錄到功能的空間整合之路
WTX與多平臺(tái)蛋白組檢測(cè)技術(shù)的有機(jī)結(jié)合,我們實(shí)現(xiàn)了從轉(zhuǎn)錄到蛋白、從定位到功能、從單細(xì)胞到微環(huán)境的全面空間解析。無(wú)論是關(guān)注腫瘤異質(zhì)性、免疫治療應(yīng)答,還是探索組織發(fā)育與疾病進(jìn)展的動(dòng)態(tài)機(jī)制,這些組合方案都能為您提供高分辨率、多維度、可拓展的空間組學(xué)整合框架,讓空間生物學(xué)的研究更具系統(tǒng)性與深度。
如果現(xiàn)有方案還是不過(guò)癮,那一定要和我們聯(lián)系,一起來(lái)定制化。