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上海生物芯片推出SMI WTX與空間蛋白聯(lián)合檢測(cè)方案

瀏覽次數(shù):107 發(fā)布日期:2025-12-3  來(lái)源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處

在空間生物學(xué)的時(shí)代浪潮中,CosMx™ Spatial Molecular Imager(SMI) 一直以單細(xì)胞級(jí)別的空間分辨率和全轉(zhuǎn)錄組級(jí)別的檢測(cè)深度領(lǐng)跑行業(yè)。如今,SMI Whole Transcriptome(WTX)再度升級(jí),不僅實(shí)現(xiàn)了18000+基因的全覆蓋轉(zhuǎn)錄組檢測(cè),更可與空間蛋白檢測(cè)同步開(kāi)展,在同一張組織切片上實(shí)現(xiàn) RNA與蛋白信號(hào)的真實(shí)共現(xiàn),讓生命過(guò)程的分子語(yǔ)言與功能行為在同一視野中被精準(zhǔn)捕捉。

圖片技術(shù)突破:?jiǎn)纹瑢?shí)現(xiàn)RNA與蛋白共檢

傳統(tǒng)空間組學(xué)研究常面臨一個(gè)核心痛點(diǎn):RNA與蛋白的檢測(cè)需依賴不同切片,跨片配準(zhǔn)誤差難以避免。而在SMI平臺(tái)上,這一問(wèn)題被徹底解決。

WTX平臺(tái)以18000+基因的全轉(zhuǎn)錄組覆蓋能力,為空間生物學(xué)提供了未有的表達(dá)深度。而在此基礎(chǔ)上,SMI Protein Panel進(jìn)一步擴(kuò)展檢測(cè)維度,覆蓋64種核心功能蛋白,不僅包括細(xì)胞膜與胞內(nèi)信號(hào)蛋白,還可檢測(cè)細(xì)胞外分泌蛋白與基質(zhì)組分。
● 免疫檢查點(diǎn)分子:PD-1、PD-L1、CTLA4
● T細(xì)胞活化與疲勞標(biāo)志:CD25、CD69、TIM3
● 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)分子:pSTAT1、pAKT
● 細(xì)胞外基質(zhì)與分泌蛋白:Collagen IV、Fibronectin、MMP9等

這套組合實(shí)現(xiàn)了轉(zhuǎn)錄組層面的系統(tǒng)性與蛋白層面的功能性完美融合,使研究者能夠在一個(gè)實(shí)驗(yàn)中,獲得同一空間坐標(biāo)下的雙維度數(shù)據(jù)。

圖片通過(guò)將轉(zhuǎn)錄組學(xué)譜與同一細(xì)胞中的蛋白質(zhì)表達(dá)相結(jié)合,更準(zhǔn)確地識(shí)別細(xì)胞類(lèi)型和狀態(tài)

方案價(jià)值:從轉(zhuǎn)錄景觀到功能真相

相比傳統(tǒng)分層檢測(cè)模式,WTX+蛋白共檢方案的價(jià)值在于四點(diǎn)核心提升:
1.真共檢,而非后配準(zhǔn):RNA與蛋白信號(hào)來(lái)自同一切片,避免跨片配準(zhǔn)誤差,使細(xì)胞狀態(tài)識(shí)別與通路分析更精準(zhǔn)可信。
2.功能維度更具解釋力:WTX提供轉(zhuǎn)錄層的全面表達(dá)背景,而蛋白數(shù)據(jù)則反映信號(hào)活性與功能執(zhí)行,實(shí)現(xiàn)表達(dá)-調(diào)控-功能的一體化解析。
3.定量關(guān)聯(lián)自然:同一細(xì)胞內(nèi)RNA豐度與蛋白表達(dá)量的聯(lián)動(dòng)可直接計(jì)算,適合開(kāi)展通路活性評(píng)分、免疫功能分層、藥物應(yīng)答預(yù)測(cè)等高價(jià)值分析。
4.功能與環(huán)境雙維解析:不僅揭示細(xì)胞內(nèi)通路活性,還可追蹤細(xì)胞外分泌因子與基質(zhì)分布,實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)胞-細(xì)胞通訊與組織微環(huán)境動(dòng)態(tài)重塑的多維解讀。

圖片通過(guò)分析完整組織內(nèi)的RNA和蛋白質(zhì),繪制細(xì)胞異質(zhì)性和細(xì)胞間相互作用,該圖像顯示了組織的細(xì)胞外成分(黃色的纖維連接蛋白)

應(yīng)用場(chǎng)景:精準(zhǔn)解析腫瘤免疫微環(huán)境

RNA 告訴我們細(xì)胞在想什么,蛋白則揭示細(xì)胞在做什么。WTX與空間蛋白共檢方案的結(jié)合,使研究者得以在同一空間坐標(biāo)下觀察基因調(diào)控與功能實(shí)現(xiàn)的全過(guò)程,真正實(shí)現(xiàn)從轉(zhuǎn)錄到功能的空間整合分析。

無(wú)論是探索腫瘤免疫逃逸機(jī)制;描繪組織發(fā)育與疾病進(jìn)展的動(dòng)態(tài)軌跡;還是構(gòu)建多模態(tài)空間圖譜,WTX+蛋白共檢方案都能為研究者提供精準(zhǔn)、直觀、全景化的分子影像視角。

圖片通過(guò)將蛋白檢測(cè)與亞細(xì)胞分辨率下的RNA表達(dá)相結(jié)合,直接在組織中確認(rèn)候選生物標(biāo)志物

例如在腫瘤免疫研究中,WTX+蛋白共檢能清晰回答以下關(guān)鍵問(wèn)題:
● 腫瘤免疫逃逸過(guò)程中,PD-L1 的高表達(dá)是否伴隨轉(zhuǎn)錄活性上調(diào)?
● T細(xì)胞在空間位置上呈現(xiàn)何種激活或耗竭譜系?
● 免疫檢查點(diǎn)分子與細(xì)胞信號(hào)通路是否在特定微區(qū)協(xié)同活躍?

這些問(wèn)題,以往需要多輪實(shí)驗(yàn)與復(fù)雜數(shù)據(jù)配準(zhǔn),而在本方案中,只需一張切片、一次檢測(cè),即可在單細(xì)胞層面完整解析。

未來(lái)已來(lái),空間組學(xué)的新標(biāo)配

WTX不僅是一個(gè)全轉(zhuǎn)錄組檢測(cè) panel,更是一套可拓展的多組學(xué)整合框架。通過(guò)與蛋白組學(xué)的深度融合,研究者得以在單細(xì)胞層面同步捕獲表達(dá)-功能的雙維度信息,讓每一個(gè)細(xì)胞的故事都被完整記錄。

從單一維度的信號(hào)捕捉,到多模態(tài)的空間整合,從靜態(tài)的組織切片,到動(dòng)態(tài)的生命圖譜,SMI WTX +蛋白共檢,讓空間組學(xué)真正進(jìn)入立體時(shí)代。

圖片

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相關(guān)公司:上海生物芯片有限公司
聯(lián)系電話:400-100-2131
E-mail:marketing@shbiochip.com


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