上海生物芯片推出SMI WTX與空間蛋白聯(lián)合檢測方案

在空間生物學(xué)的時代浪潮中，CosMx™ Spatial Molecular Imager（SMI） 一直以單細(xì)胞級別的空間分辨率和全轉(zhuǎn)錄組級別的檢測深度領(lǐng)跑行業(yè)。如今，SMI Whole Transcriptome（WTX）再度升級，不僅實(shí)現(xiàn)了18000+基因的全覆蓋轉(zhuǎn)錄組檢測，更可與空間蛋白檢測同步開展，在同一張組織切片上實(shí)現(xiàn) RNA與蛋白信號的真實(shí)共現(xiàn)，讓生命過程的分子語言與功能行為在同一視野中被精準(zhǔn)捕捉。

傳統(tǒng)空間組學(xué)研究常面臨一個核心痛點(diǎn)：RNA與蛋白的檢測需依賴不同切片，跨片配準(zhǔn)誤差難以避免。而在SMI平臺上，這一問題被徹底解決。

WTX平臺以18000+基因的全轉(zhuǎn)錄組覆蓋能力，為空間生物學(xué)提供了未有的表達(dá)深度。而在此基礎(chǔ)上，SMI Protein Panel進(jìn)一步擴(kuò)展檢測維度，覆蓋64種核心功能蛋白，不僅包括細(xì)胞膜與胞內(nèi)信號蛋白，還可檢測細(xì)胞外分泌蛋白與基質(zhì)組分。
● 免疫檢查點(diǎn)分子：PD-1、PD-L1、CTLA4
● T細(xì)胞活化與疲勞標(biāo)志：CD25、CD69、TIM3
● 信號轉(zhuǎn)導(dǎo)分子：pSTAT1、pAKT
● 細(xì)胞外基質(zhì)與分泌蛋白：Collagen IV、Fibronectin、MMP9等

這套組合實(shí)現(xiàn)了轉(zhuǎn)錄組層面的系統(tǒng)性與蛋白層面的功能性完美融合，使研究者能夠在一個實(shí)驗(yàn)中，獲得同一空間坐標(biāo)下的雙維度數(shù)據(jù)。

方案價值：從轉(zhuǎn)錄景觀到功能真相

相比傳統(tǒng)分層檢測模式，WTX+蛋白共檢方案的價值在于四點(diǎn)核心提升：
1.真共檢，而非后配準(zhǔn)：RNA與蛋白信號來自同一切片，避免跨片配準(zhǔn)誤差，使細(xì)胞狀態(tài)識別與通路分析更精準(zhǔn)可信。
2.功能維度更具解釋力：WTX提供轉(zhuǎn)錄層的全面表達(dá)背景，而蛋白數(shù)據(jù)則反映信號活性與功能執(zhí)行，實(shí)現(xiàn)表達(dá)-調(diào)控-功能的一體化解析。
3.定量關(guān)聯(lián)自然：同一細(xì)胞內(nèi)RNA豐度與蛋白表達(dá)量的聯(lián)動可直接計(jì)算，適合開展通路活性評分、免疫功能分層、藥物應(yīng)答預(yù)測等高價值分析。
4.功能與環(huán)境雙維解析：不僅揭示細(xì)胞內(nèi)通路活性，還可追蹤細(xì)胞外分泌因子與基質(zhì)分布，實(shí)現(xiàn)對細(xì)胞-細(xì)胞通訊與組織微環(huán)境動態(tài)重塑的多維解讀。

應(yīng)用場景：精準(zhǔn)解析腫瘤免疫微環(huán)境

RNA 告訴我們細(xì)胞在想什么，蛋白則揭示細(xì)胞在做什么。WTX與空間蛋白共檢方案的結(jié)合，使研究者得以在同一空間坐標(biāo)下觀察基因調(diào)控與功能實(shí)現(xiàn)的全過程，真正實(shí)現(xiàn)從轉(zhuǎn)錄到功能的空間整合分析。

無論是探索腫瘤免疫逃逸機(jī)制；描繪組織發(fā)育與疾病進(jìn)展的動態(tài)軌跡；還是構(gòu)建多模態(tài)空間圖譜，WTX+蛋白共檢方案都能為研究者提供精準(zhǔn)、直觀、全景化的分子影像視角。

例如在腫瘤免疫研究中，WTX+蛋白共檢能清晰回答以下關(guān)鍵問題：
● 腫瘤免疫逃逸過程中，PD-L1 的高表達(dá)是否伴隨轉(zhuǎn)錄活性上調(diào)？
● T細(xì)胞在空間位置上呈現(xiàn)何種激活或耗竭譜系？
● 免疫檢查點(diǎn)分子與細(xì)胞信號通路是否在特定微區(qū)協(xié)同活躍？

這些問題，以往需要多輪實(shí)驗(yàn)與復(fù)雜數(shù)據(jù)配準(zhǔn)，而在本方案中，只需一張切片、一次檢測，即可在單細(xì)胞層面完整解析。

未來已來，空間組學(xué)的新標(biāo)配

WTX不僅是一個全轉(zhuǎn)錄組檢測 panel，更是一套可拓展的多組學(xué)整合框架。通過與蛋白組學(xué)的深度融合，研究者得以在單細(xì)胞層面同步捕獲表達(dá)-功能的雙維度信息，讓每一個細(xì)胞的故事都被完整記錄。

從單一維度的信號捕捉，到多模態(tài)的空間整合，從靜態(tài)的組織切片，到動態(tài)的生命圖譜，SMI WTX +蛋白共檢，讓空間組學(xué)真正進(jìn)入立體時代。

如果你希望了解更多 WTX 聯(lián)合檢測方案（如WTX+PCF、WTX+DSP、WTX+LCM等），敬請持續(xù)關(guān)注后續(xù)推文，我們將逐一揭曉每種組合的技術(shù)亮點(diǎn)與應(yīng)用價值。想要更深入了解或定制化方案？歡迎與我們聯(lián)系，一起探索空間多組學(xué)的更多可能！