年度旗艦級單細胞空間組學平臺CosMx SMI- Whole Transcriptome Panel(WTX) 不止于單細胞空間轉錄組學的突破,更以全轉錄組覆蓋(18000+基因)的無偏檢測能力,重新定義生命動態(tài)圖譜研究的維度。但這還不夠,我們還想要空間蛋白維度的檢測,全景觀觀測生命過程、組織微環(huán)境。
當傳統(tǒng)技術困于局部信號捕捉,WTX已實現(xiàn)從單細胞分辨率到全轉錄組的無縫覆蓋,讓組織微環(huán)境中每個細胞的表達密碼都清晰可辨。但我們深知:生命是復雜的,所以我們渴望更全景的視角:將空間蛋白維度深度融合,實現(xiàn)對生命進程與組織微環(huán)境的多模態(tài)、全尺度觀測。
為實現(xiàn)這一目標,我們以“技術宅”式的嚴謹,將多元技術模塊視作待選的“食材”:不滿足于簡單堆砌,而是歷經(jīng)深度適配,沉淀出開箱即用的“全棧式解決方案”——讓前沿的空間轉錄組與空間蛋白檢測技術,真正成為您探索生命圖譜的趁手利器。

1. WTX +蛋白panel同片檢測
CosMx SMI平臺獨有的優(yōu)勢在于,能夠在同一張組織切片上同時完成全轉錄組與多重蛋白的共檢測,實現(xiàn)真正的單細胞分辨率空間多組學同步識別。當前的SMI Protein Panel覆蓋64種關鍵蛋白,包含免疫檢查點分子(如PD-1、PD-L1、CTLA4)、T細胞活化標志物(CD69、CD25等)以及信號轉導分子(pSTAT1、pAKT)等,為免疫治療機制研究與免疫微環(huán)境表型刻畫提供強有力支持。
● 主要優(yōu)勢:
單片共檢測:只需一張切片檢測,RNA與蛋白信號來源一致,避免跨切片配準誤差。
功能分子覆蓋精準:以免疫相關分子為核心,特別適用于T細胞活化狀態(tài)、免疫逃逸機制、腫瘤-免疫界面研究。
數(shù)據(jù)關聯(lián)自然:同一空間區(qū)域,同一細胞,可直接關聯(lián)轉錄表達與蛋白豐度變化,開展信號通路活性評估與細胞狀態(tài)分類。
2. WTX +PCF
PCF(PhenoCycler-Fusion)利用多輪次成像,突破傳統(tǒng)熒光成像通道限制,支持100種以上蛋白標志物同時檢測,并可以實現(xiàn)單細胞分辨率的空間蛋白組譜繪制。IO60 panel是即用型一款腫瘤及免疫多重抗體組合,涵蓋60個經(jīng)驗證的人源FFPE樣本標志物,可在一次實驗中全面解析腫瘤細胞、基質(zhì)細胞及免疫微環(huán)境結構,為多癌種的腫瘤微環(huán)境構成與空間異質(zhì)性解析提供高效標準化方案。通過將SMI WTX的轉錄信息與IO60的蛋白圖譜相結合,研究者能夠從兩個維度重構腫瘤及其微環(huán)境的全景觀空間圖譜。
● 主要優(yōu)勢:
空間分辨率匹配:IO60可實現(xiàn)與SMI相同的亞細胞級空間分辨率,確保RNA-Protein層面數(shù)據(jù)精準對齊。
IO60 panel將腫瘤標記物覆蓋全面,細胞類型解析深入:涵蓋腫瘤細胞(PanCK、SOX2、TP63、角蛋白家族)、基質(zhì)細胞(Podoplanin、Caveolin、Collagen IV、E-cadherin)、髓系細胞(CD206、CD209、MPO)及NK細胞(CD57、CD107)等多種特異性標記,能夠系統(tǒng)刻畫腫瘤、免疫與基質(zhì)間的復雜關系。
高度靈活定制:在IO60 panel基礎上可根據(jù)研究目的靈活增加定制蛋白靶標,兼顧標準化與創(chuàng)新性。
3. WTX +DPA(GeoMx DSP)
GeoMx DSP的DPA(Discovery Proteome Atlas)panel可在單次實驗中同時檢測超過1200種蛋白。這是目前基于抗體的通量最高的商業(yè)化空間蛋白檢測平臺。DPA是專為支持生物標志物發(fā)現(xiàn)而設計的檢測方案,涵蓋多種組織類型、機制通路及研究領域,包括癌癥、免疫學和神經(jīng)生物學:
兼容40+種人類組織
涵蓋120+種生物學過程
包含29類功能注釋(細胞凋亡、分化、DNA損傷修復、MAPK Signaling、mTOR Signaling、PI3K-Akt Signaling等)
當DPA與WTX技術結合時,可在轉錄組與蛋白組兩個層面實現(xiàn)“全局+局域”相結合的空間整合分析。
● 主要優(yōu)勢:
極高通量:實現(xiàn)從免疫、信號轉導、代謝到細胞骨架等多維蛋白網(wǎng)絡的全面覆蓋。
靈活的ROI選擇:GeoMX DSP具備精細的區(qū)域劃分與定向檢測能力,可針對特定細胞類型或病理區(qū)域進行深度蛋白分析
互補信息融合:SMI WTX提供精確的空間細胞分型,DPA補充大規(guī)模蛋白表達特征,實現(xiàn)“定域-定性-定量”三重融合。
4. WTX+深度蛋白組(LCM)
通過LCM(Laser Capture Microdissection)激光顯微切割技術,可在組織水平上精準切割感興趣的區(qū)域,并結合質(zhì)譜實現(xiàn)全蛋白組無偏檢測。當與WTX組合時,可先通過轉錄組信息識別關鍵功能區(qū)域,再由LCM-MS完成深度蛋白挖掘,不受任何抗體限制。
● 主要優(yōu)勢:
精準切割、區(qū)域特異:依據(jù)組織形態(tài)或SMI識別的功能區(qū)域進行精確定義與切割,確?臻g信息精準可控。
無偏全蛋白組覆蓋:無需預設抗體panel,可檢測所有表達蛋白,發(fā)現(xiàn)未知分子機制。
機制驗證利器:SMI轉錄組信息引導感興趣區(qū)域定位,LCM-MS實現(xiàn)蛋白深度挖掘,形成空間機制研究的閉環(huán)路。
從轉錄到功能的空間整合之路
WTX與多平臺蛋白組檢測技術的有機結合,我們實現(xiàn)了從轉錄到蛋白、從定位到功能、從單細胞到微環(huán)境的全面空間解析。無論是關注腫瘤異質(zhì)性、免疫治療應答,還是探索組織發(fā)育與疾病進展的動態(tài)機制,這些組合方案都能為您提供高分辨率、多維度、可拓展的空間組學整合框架,讓空間生物學的研究更具系統(tǒng)性與深度。
如果現(xiàn)有方案還是不過癮,那一定要和我們聯(lián)系,一起來定制化。