為什么要進(jìn)行細(xì)胞STR鑒定

細(xì)胞系
細(xì)胞是生命的基本單位，對(duì)細(xì)胞的研究和應(yīng)用已經(jīng)滲透到現(xiàn)代社會(huì)的方方面面：細(xì)胞治療（Cell Therapy）、干細(xì)胞移植、再生醫(yī)學(xué)、藥物研發(fā)與篩選、病理學(xué)研究等，從保障人類(lèi)健康到推動(dòng)工業(yè)生產(chǎn)，再到探索生命奧秘。細(xì)胞作為“微型工廠”，被用于生產(chǎn)有價(jià)值的產(chǎn)品如重組蛋白生產(chǎn)等都有細(xì)胞的貢獻(xiàn)和身影。
細(xì)胞系，指原代細(xì)胞（直接從生物體組織分離的細(xì)胞）經(jīng)過(guò)傳代成功后，所產(chǎn)生的一種具有無(wú)限或有限增殖能力的細(xì)胞群體。比較著名的有 HEK 293（人胚胎腎細(xì)胞系）、HeLa（宮頸癌細(xì)胞系）細(xì)胞系，還有H1、H9、293T、Vero、A549等細(xì)胞系。HeLa 宮頸癌（來(lái)自患者Henrietta Lacks）是很早的一個(gè)人類(lèi)細(xì)胞系，增殖速度極快，研究得比較透徹的細(xì)胞系之一，用于藥物測(cè)試、細(xì)胞生物學(xué)、病毒學(xué)、癌癥研究等領(lǐng)域。需要注意的是：因其生長(zhǎng)強(qiáng)勢(shì)，極易污染其他細(xì)胞培養(yǎng)物。
細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程中需要注意的問(wèn)題
交叉污染與錯(cuò)誤鑒定：這是細(xì)胞培養(yǎng)中非常嚴(yán)重的問(wèn)題之一。HeLa細(xì)胞因其生長(zhǎng)強(qiáng)勢(shì)，污染了無(wú)數(shù)其他細(xì)胞系。許多所謂的特殊細(xì)胞系后來(lái)被發(fā)現(xiàn)其實(shí)是HeLa細(xì)胞。甚至之前頂級(jí)期刊發(fā)表的論文用的細(xì)胞系都是錯(cuò)誤的使用了Hela而不是本身認(rèn)定的細(xì)胞系，因此，定期進(jìn)行細(xì)胞系鑒定（STR profiling）非常重要。
傳代次數(shù)與遺傳漂變：細(xì)胞系在長(zhǎng)期傳代過(guò)程中會(huì)發(fā)生遺傳和表型變化，導(dǎo)致細(xì)胞系發(fā)生了改變。所以實(shí)驗(yàn)應(yīng)使用傳代次數(shù)相近的細(xì)胞，并避免培養(yǎng)過(guò)久，或者在使用前進(jìn)行細(xì)胞系的鑒定。
什么是STR
通過(guò)檢測(cè)STR的方式進(jìn)行細(xì)胞鑒定，那么什么是STR呢？
STR短串聯(lián)重復(fù)（STR, Short Tandem Repeat）,STR又稱微衛(wèi)星DNA或簡(jiǎn)單重復(fù)序列（SRS或SSR）指的是存在于基因組DNA（主要是核DNA）非編碼區(qū)中的一種特定類(lèi)型的重復(fù)DNA序列。其廣泛存在于人類(lèi)及哺乳動(dòng)物的基因組中，由2-6個(gè)堿基構(gòu)成的核心序列串聯(lián)重復(fù)排列形成。其重復(fù)次數(shù)由滑鏈錯(cuò)配在細(xì)胞分裂（尤其減數(shù)分裂）中積累所致。
STR是第二代遺傳標(biāo)記（第一代是限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性RFLP，第三代是單核苷酸多態(tài)性SNP）。同一個(gè)STR基因座上，個(gè)體之間的重復(fù)的次數(shù)可能存在差異，特定的重復(fù)次數(shù)對(duì)應(yīng)一個(gè)等位基因。多態(tài)性主要產(chǎn)生機(jī)制是 DNA復(fù)制過(guò)程中的“滑鏈錯(cuò)配”。同時(shí)分析多個(gè)高度多態(tài)性的STR位點(diǎn)，產(chǎn)生的基因型組合在無(wú)關(guān)個(gè)體中相同的數(shù)學(xué)概率可以低至萬(wàn)億分之一甚至更低。
 
通過(guò)檢測(cè)STR的方式進(jìn)行細(xì)胞鑒定的原理
1）STR具有多態(tài)性
因?yàn)镾TR具有多態(tài)性，多個(gè)STR位點(diǎn)組合，進(jìn)行鑒定的分辨率很高�？墒褂玫�13個(gè)STR位點(diǎn)，覆蓋不同染色體區(qū)域，可以區(qū)分全球70億人的基因，無(wú)關(guān)個(gè)體匹配概率＜10-15（STR位點(diǎn)等位基因數(shù)量范圍介于7-26個(gè)之間）。
 
2）組織間序列一致性
同一個(gè)個(gè)體的各種組織DNA具有相同的序列特征，例如來(lái)自皮膚的DNA和肌肉的DNA是一樣的，相匹配的，這說(shuō)明STR分析可以在不同組織間進(jìn)行。
 
越來(lái)越多的雜志在投稿時(shí)要求提供細(xì)胞STR分析數(shù)據(jù)，STR已被ATCC等機(jī)構(gòu)作為細(xì)胞鑒定的金標(biāo)準(zhǔn)。
美國(guó)的ATCC細(xì)胞庫(kù)、德國(guó)的DSMZ細(xì)胞庫(kù)以及日本的JCRB細(xì)胞庫(kù)等為STR分型提供了各細(xì)胞株的數(shù)據(jù)供比對(duì)。通過(guò)細(xì)胞STR鑒定，可以避免由于細(xì)胞系交叉污染或品系使用錯(cuò)誤導(dǎo)致的時(shí)間金錢(qián)的浪費(fèi)和時(shí)間數(shù)據(jù)的不準(zhǔn)確性。
所以我們建議在以下情況下提前進(jìn)行細(xì)胞鑒定：
1）發(fā)表文章前
2）使用細(xì)胞進(jìn)行實(shí)驗(yàn)前
3）準(zhǔn)備凍存保種或已凍存多年的細(xì)胞
4）細(xì)胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大
5）對(duì)細(xì)胞身份產(chǎn)生懷疑